Wydział jest instytucją naukowo-dydaktyczną i umożliwia studiowanie teologii kandydatom do kapłaństwa, przyszłym katechetom, jak też innym osobom, zabiegającym o szeroko rozumianą formację humanistyczną lub o pogłębienie formacji religijnej. 

Wydział prowadzi jednolite studia magisterskie w dwóch specjalnościach: specjalności kapłańskiej oraz specjalności katechetyczno-pastoralnej. Na Wydziale odbywają się także studia licencjackie i podyplomowe.

Zajęcia naukowo-dydaktyczne prowadzą pracownicy naukowo-dydaktyczni zatrudnieni przez UP JPII w Krakowie oraz zatrudnieni przez Wyższe Seminarium Duchowne w Tarnowie. Nauczyciele akademiccy prowadzą systematyczne badania naukowe. Biorą udział w konferencjach naukowych w wielu miejscach w Polsce oraz za granicą. Uczestniczą w badaniach naukowych w ramach grantów krajowych oraz rozwijają współpracę z innymi ośrodkami teologicznymi w Polsce i na świecie.